พันธุศาสตร์ประชากร

ยอดวิว 0

แบบฝึกหัด

EASY

พันธุศาสตร์ประชากร (ชุดที่ 1)

HARD

พันธุศาสตร์ประชากร (ชุดที่ 2)

เนื้อหา

พันธุศาสตร์ประชากร


คำศัพท์ควรรู้

Allele (อัลลีล) คือ ลักษณะการแสดงออกของยีนในรูปแบบต่าง ๆ เช่น ยีนที่ควบคุมสีตา อาจจะมี allele เป็นสีน้ำตาล หรือ สีฟ้า

Allele frequency (ความถี่อัลลีล) อัตราส่วน
ของอัลลีลแต่ละรูปแบบต่อผลรวมอันเดียวทั้งหมดในประชากรดังนั้นผลรวมของความถี่อัลลีลจะเป็นหนึ่งเสมอ

Population (ประชากร) คือ กลุ่มของสิ่งมีชีวิตชนิดใดชนิดหนึ่งอาศัยอยู่ร่วมกัน ณ บริเวณหนึ่ง โดยมีการแลกเปลี่ยนของยีนภายในประชากร หรือมี
gene Flow  และมีการใช้ gene pool ร่วมกัน

Gene Pool หมายถึง เมื่อนำรูปแบบหรืออัลลีลต่าง ๆ ของยีนของสิ่งมีชีวิตทุกตัวในประชากรรวมกัน


Population genetics  
พันธุศาสตร์ประชากร

หมายถึง การศึกษาลักษณะทางพันธุกรรมและการแปรผันทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในระดับประชากรของสิ่งมีชีวิต เช่น การเปลี่ยนแปลงความถี่ของอัลลีลในประชากรนั้น ๆ
ผลกระทบของความถี่ของอัลลีลที่มีต่อวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิตในประชากรนั้น ๆ


Genotype frequency 
ความถี่จีโนไทป์ 

ตัวอย่าง การหาความถี่จีโนไทป์
เช่น การกำหนดสีของดอกไม้

ให้ยีนที่ควบคุมสีของดอกไม้มี 2 อัลลีล A เป็นอัลลีลเด่น ควบคุมลักษณะสีแดง และ a เป็นอัลลีลด้อย ควบคุมลักษณะสีขาว

เมื่อประชากรพืชดอกนี้มีจำนวน 10000 ต้น มีลักษณะและจำนวนจีโนไทป์ต่าง ๆ ดังนี้

     AA จำนวน 4900 ต้น ความถี่จีโนไทป์ 0.49

     Aa จำนวน 4200 ต้น ความถี่จีโนไทป์ 0.42

     aa จำนวน 900 ต้น ความถี่จีโนไทป์ 0.09
     
ผลรวมทั้งหมด = 1.00

ผลรวมของอัตราส่วนของจีโนไทป์ทั้งหมด
ต่อประชากรจะได้เท่ากับ 1 เสมอ*

Phenotype frequency 
ความถี่ฟีโนไทป์

ฟีโนไทป์ หมายถึง การแสดงออกของยีน

  • สิ่งที่เหมือนกันกับความถี่จีโนไทป์ คือ ผลรวมของความถี่ฟีโนไทป์จะมีค่าเท่ากับ 1 เสมอเช่นกัน
  • ข้อแตกต่าง คือ  ความถี่จีโนไทป์จะรวมเอาความถี่จีโนไทป์ของยีนเด่น รวมกับความถี่จีโนไทป์ของ heterozygous เนื่องจาก A เป็นยีนเด่นจึงถูกแสดงออกเป็นฟีโนไทป์ โดย a ซึ่งเป็นยีนด้อยที่อยู่ใน heterozygous ไม่ถูกแสดงออก


*ต่อเนื่องจากตัวอย่างที่แล้ว

Phenotype (A-: AA + Aa) = 4900 + 4200
                                     = 9100
ความถี่ฟีโนไทป์ = 9100/10000 = 0.91

            (aa) = 900
ความถี่ฟีโนไทป์ = 900/10000 = 0.09

ผลรวมความถี่ฟีโนไทป์ = 0.91+0.09 = 1.00

Hardy-Weinberg Equilibrium
หรือ genetic equilibrium
 

ทั้งนี้ G. Hardy และ W. Weinberg ได้อธิบายไว้ว่า

วามถี่อัลลีล และความถี่จีโนไทป์ของประชากรจะคงที่จากรุ่นสู่รุ่น เรียกว่า ประชากรอยู่ในภาวะสมดุล เมื่อประชากรของสิ่งมีชีวิตอยู่ในภาวะสมดุลฮาร์ดีไวน์เบิร์กจะไม่มีการเกิดวิวัฒนาการ

สภาวะสมดุลฮาร์ดีไวน์เบิร์กเกิดขึ้นภายใต้เงื่อนไขเหล่านี้

  1. No natural selection ไม่มีการคัดเลือกทางธรรมชาติเกิดขึ้นในประชากรของสิ่งมีชีวิตนั้น ๆ
  2. No migration ไม่มีการเปลี่ยนแปลงจำนวนประชากรย้ายเข้าย้ายออก หรือไม่มี gene flow ระหว่างกลุ่มประชากร
  3. No genetic drift กลุ่มประชากรมีขนาดใหญ่ไม่เกิดปรากฏการณ์คอขวดของกลุ่มประชากร หมายความว่า กลุ่มประชากรเล็ก ๆ ถูกแยกออกมาจากกลุ่มประชากรขนาดใหญ่ ทำให้ความถี่ของจีโนไทป์ไม่สะท้อนถึงความถี่ของจีโนไทป์ในประชากรใหญ่ เช่น กลุ่มประชากรชาวญี่ปุ่นหลังจากภาวะสงครามโลก เป็นการเพิ่มจำนวนประชากรจากจำนวนประชากรเริ่มต้นจำนวนน้อย เนื่องจากมีผู้คนล้มตายจากภาวะสงครามโลกเป็นจำนวนมาก
  4. Random mating  มีการผสมพันธุ์แบบสุ่มในกลุ่มประชากรสิ่งมีชีวิต ไม่มี bias ในการเลือกคู่ผสมพันธุ์
  5. No mutations ไม่มีการกลายพันธุ์ของสิ่งมีชีวิตในกลุ่มประชากร

ในความเป็นจริงแล้วเงื่อนไขดังกล่าวแทบไม่พบในธรรมชาติ หรือพบได้น้อยมาก หรือต้องจำกัดระยะเวลาการศึกษาในเวลาสั้น ๆ เมื่อสิ่งมีชีวิตไม่ได้อยู่ในสภาวะสมดุลของฮาร์ดีไวน์เบิร์ก สิ่งมีชีวิตในประชากรนั้นจะเกิดวิวัฒนาการในระดับจุลภาค หรือมีการเปลี่ยนแปลงความถี่ของจีโนไทป์ของสิ่งมีชีวิตในประชากร


 สมดุลฮาร์ดีไวน์เบิร์กในภาษาคณิตศาสตร์ คือ
     P  = ความถี่ของแอลลีล A ในประชากร
     Q = ความถี่ของแอลลีล a ในประชากร


เมื่อผลรวมของความถี่แอลลีลในประชากรหนึ่งหนึ่งมีค่าเท่ากับ 1 เสมอ ดังนั้น

เมื่อให้  PxP     แทนค่าความถี่ของจีโนไทป์ AA
         2PxQ   แทนค่าความถี่ของจีโนไทป์ Aa
         QxQ    แทนค่าความถี่ของจีโนไทป์ aa  
จะได้ว่า   
    P + Q = 1; (P+Q)2 = 1 ; P2 + 2PQ + Q2 = 1


ตัวอย่าง การคำนวณความถี่แอลลีลในประชากร

ประชากรของแมวกลุ่มหนึ่งมีจำนวน 300 ตัว โดยแมว 147 ตัวมีลักษณะเป็น homozygous dominant หรือมียีนเด่นสำหรับขนสีดำ (AA) แมว 126 ตัวมีลักษณะเป็น heterozygous (Aa) และอีก 27 ตัว มีลักษณะเป็น homozygous recessive (aa) โดยมีขนสีขาว ประชากรแมวกลุ่มนี้อยู่ในสภาวะฮาร์ดีไวน์เบิร์ก จงคำนวณหาค่าดังต่อไปนี้
  1. จงหาค่าความถี่แอลลีล  A และความถี่แอลลีล a
  2. จงหาค่าความถี่จีโนไทป์ AA, Aa, และ aa
วิธีทำ

1.) ความถี่แอลลีล  A
=  จำนวน แอลลีล  A ในประชากร  
  จำนวน แอลลีลทั้งหมดในประชากร           
=  (147 x 2) + 126
             600
420     =   0.7 
    600

ความถี่แอลลีล a = 1 - ความถี่แอลลีล  A = 0.3
2.) ความถี่ของจีโนไทป์ AA  = 147/300
                                     = 0. 49
     ความถี่ของจีโนไทป์ Aa  = 126/300 
                                     = 0.42
     ความถี่ของจีโนไทป์ aa   =  27/300   
                                     = 0.09


ทีมผู้จัดทำ