สารโคเวเลนต์ที่อยู่ในอุณหภูมิห้องอาจจะอยู่ในสถานะต่างกันขึ้นอยู่กับแรงยึดเหนี่ยวระหว่างโมเลกุล (intermolecular force) หรือ แรงแวนเดอร์วาลส์ (van der Waals force)
การศึกษาแรงยึดเหนี่ยวระหว่างโมเลกุลนิยมพิจารณาจากจุดเดือดของสาร แก๊สเฉื่อยและสารโคเวเลนต์ไม่มีขั้วส่วนใหญ่จะมีจุดเดือดต่ำ เนื่องจากมีแรงยึดเหนี่ยวระหว่างโมเลกุลน้อย
นอกจากนี้ สารที่มีขนาดโมเลกุลใหญ่ขึ้นยังมีจุดเดือดสูงขึ้นด้วย
แรงนี้มีหลายชนิดและมีชื่อเรียกต่าง ๆ กัน แรง 3 ชนิดที่สำคัญ คือ
แรงนี้เกิดขึ้นได้ในทุกอะตอมและโมเลกุล ในช่วงเวลาขณะหนึ่งมีการกระจายตัวของอิเล็กตรอนไม่เท่ากัน จึงก่อให้เกิดขั้วเล็กน้อยในโมเลกุลทำให้เกิดแรงเหนี่ยวนำไปยังโมเลกุลข้างเคียง แรงแผ่กระจายลอนดอนมีค่าสูงขึ้นเมื่อโมเลกุลมีขนาดใหญ่ขึ้นเนื่องจากโมเลกุลขนาดใหญ่สามารถเกิดสภาพขั้วชั่วขณะได้มากกว่า
ตัวอย่างเช่น
โมเลกุลของฮาโลเจน F2 Cl2 Br2 และ I2 โดย F2 และ Cl2 เป็นแก๊สที่อุณหภูมิห้อง Br2 เป็นของเหลว และ I2 เป็นของแข็ง
ในโมเลกุลมีขั้ว นอกจากแรงแผ่กระจายลอนดอนแล้วยังมีแรงระหว่างขั้วด้วยซึ่งเป็นแรงดึงดูดระหว่างขั้วตรงข้ามของโมเลกุล แรงนี้มีค่าประมาณ 5 kJ ถึง 20 kJ ซึ่งน้อยกว่าพันธะไออนิกหรือโควาเลนต์มากและจะมีผลเมื่อโมเลกุลเข้ามาอยู่ใกล้ ๆ กัน
ตัวอย่างเช่น
แรงดึงดูดระหว่างโมเลกุล ICl
พันธะไฮโดรเจนเป็นพันธะระหว่างอะตอมของไฮโดรเจนที่มีพันธะกับอะตอมที่มีค่าอิเล็กโตรเนกาติวิตีสูงกว่ามาก โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ไนโตรเจน (N) ออกซิเจน (O) หรือ ฟลูออรีน (F) ซึ่งจะถูกเรียกว่าผู้ให้พันธะไฮโดรเจน (hydrogen bond donor) และอะตอมที่มีค่าอิเล็กโตรเนกาติวิตีสูงอีกอะตอมหนึ่งซึ่งมีอิเล็กตรอนคู่โดดเดี่ยว ซึ่งจะถูกเรียกว่าตัวรับพันธะไฮโดรเจน (hydrogen bond acceptor) พันธะไฮโดรเจนจะมีความแข็งแรงกว่าแรงระหว่างขั้วทั่ว ๆ ไปประมาณ 5-10 เท่า สารประกอบไฮโดรเจนที่มีพันธะไฮโดรเจนมักจะมีจุดเดือดสูงกว่าสารประกอบไฮโดรเจนในหมู่เดียวกันที่ไม่มีพันธะไฮโดรเจนและค่าจุดเดือดไม่เป็นไปตามแนวโน้มของขนาดโมเลกุล
ตัวอย่างเช่น
สารที่มีพันธะไฮโดรเจน ได้แก่ HF H2O NH3 CH3OH H2O2 HCOOH CH3NH2
แรงยึดเหนี่ยวระหว่างโมเลกุล มีผลต่อจุดหลอมเหลวและจุดเดือดของของสารโคเวเลนต์ สารที่มีแรงยึดเหนี่ยวสูงก็จะมีจุดหลอมเหลวและจุดเดือดสูง นอกจากนี้แรงยึดเหนี่ยวระหว่างโมเลกุลยังมีผลต่อการละลายน้ำของสาร สารโคเวเลนต์ที่ไม่มีขั้วส่วนใหญ่จะไม่ละลายหรือละลายน้ำได้น้อย
เช่น
CCl4 N2O2
ส่วนสารที่มีสภาพขั้วสูงก็จะละลายน้ำได้ โมเลกุลที่เกิดพันธะไฮโดรเจนกับน้ำได้ ก็จะละลายในน้ำได้